了解神经干细胞的分化过程和神经前体细胞的命运决定对于再生医学领域有重要的意义。在神经系统发育的过程中，神经祖细胞既要维持自我更新，又要分化成各种类型的神经细胞，而这种分化与自我更新之间的平衡是依靠多种...即将发布
日期：2012年5月26日 - 来自
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近日，来自山东省医学科学院基础医学研究所的邵倩倩等人发现，金属蛋白酶组织抑制因子3通过调节树突细胞，影响了Th1/Th2的平衡。相关研究成果发表于5月17日发表在Blood上。Th1、Th2细胞是Th...即将发布
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近日，美国美国梅奥临床医学院的研究人员发现，钠氢交换调控因子(NHERF-2)能够维持内皮细胞的稳定。相关研究成果于5月17日发表在Blood上。钠氢交换调控因子(NHERF-2)是几乎所有内皮细胞(...即将发布
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来自中科院上海生科院神经所的研究人员发表了题为“c-Maf is required for the development of dorsal horn laminae III/IV neurons and mechanoreceptive DRG axon projections”的文章，发现了转录因子c-Maf能调控脊髓背角及背根神经节中机械感觉神经元的发育，这揭示了c-Maf在脊髓背角III/IV层神经元发育、背根神经节RA LTM的发育及其投射建立中的重要作用。相关成果公布在The Journal of Neuroscience杂志上。
文章的通讯作者是神经所神经发育及其调控机理研究组程乐平研究员，第一作者是博士研究生胡佳和黄天文，其中程乐平研究员曾在美国哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究所从事博士后研究，2005年回国进入上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所。
正常的躯体感觉依赖于外周背根神经节（DRG）及其投射区–脊髓背角神经元间建立精确的连接。机械刺激（包括物体质地、形状、振动及压力等信息）被外周感觉小体中的DRG机械感觉神经元接收，并向中枢投射至脊髓背角的III/IV层及脑形成触压觉。
目前已知一些分子在脊髓背角神经元、感知痛觉及本体感觉的DRG神经元的发育中发挥重要作用。然而，关于参与形成触压觉的脊髓背角III/IV层神经元及DRG中低阈值的机械感觉神经元（low-threshold mechanoreceptor, LTM）的发育，目前的报道还很少。
在这篇文章中，研究人员利用原位杂交及免疫组化染色等技术，发现转录因子c-Maf特异表达在脊髓背角的III/IV层神经元及背根神经节有髓鞘的中大直径神经元中。通过分析敲除小鼠的表型，发现c-Maf 调控脊髓背角III/IV层神经元的发育。
进一步实验表明，c-Maf 基因敲除特异影响表达MafA、Ret及GFRα2的快适应性（rapidly adapting, RA）LTM的发育及其向中枢脊髓背角III/IV层神经元与外周帕西尼氏小体（Pacinian corpuscles）的投射。该研究结果揭示了转录因子c-Maf在脊髓背角III/IV层神经元发育、背根神经节RA LTM的发育及其投射建立中的重要作用。
同期The Journal of Neuroscience杂志还发表了题为“c-Maf Helps Specify RA Afferent Fate（c-Maf 帮助决定RA传入纤维命运）”的点评文章，对这一成果进行了介绍。
程乐平研究组此前还曾在JBC杂志上发表了与另一研究组合作的成果：提出了不同转录因子的时空组合决定Nestin基因表达的新机制，这必将丰富人们对神经前体细胞的生物特性的认识。（来源：生物通 万纹）
近日来自北卡罗莱纳大学莱恩伯格综合癌症中心的研究人员揭示了一个在体细胞重编程中扮演重要角色的表观遗传学因子及其分子作用机制。相关研究论文在线发表在4月22日的《自然—细胞生物学》（Nature Cell Biology）杂志上。
领导这一研究的是北卡罗莱纳大学医学院生物化学与生物物理学系教授，霍华德•休斯医学研究院(HHMI)研究员的张毅教授。其早年在中国农业大学获得学士、硕士学位，在佛罗里达州立大学获得博士学位。是2008年汤姆森科技信息集团旗下《科学观察》(Science Watch)评出的高影响力论文数量最多的研究人员中，分子生物学和遗传学领域高影响力论文的数量最多的前十位顶级科学家之一。
2006年日本科学家山中申弥首次利用病毒载体将四个转录因子（Oct4，Sox2，Klf4和c-myc）的组合转入分化的体细胞中，使其重编程而得到了类似胚胎干细胞的一种细胞类型——诱导多能干细胞（iPSCs）。这种通过将完全分化的体细胞重编程，不经胚胎阶段而直接逆转至多能干细胞状态的iPS 细胞被科学家们视为最有希望运用到再生医学及新药开发的重要资源，为人类各种遗传性及功能性疾病的研究和治疗带来了新希望。
尽管近年来iPS技术不断取得发展，各种改良技术时有出现。然而重编程效率低下一直都是科学家们头疼的问题。成为了iPS临床转化的重要障碍之一。解析体细胞重编程过程中的分子调控机制，开发出高效安全的iPS技术成为了近年来干细胞领域研究人员的热点。
转录因子介导体细胞重编程为多能干细胞(iPSCs)从本质上将就是一种改写细胞命运的表观遗传学过程。过去的研究证实通过添加其他的因子可以促进这一低效的进程。为了获得对重编程机制的了解，北卡罗莱纳大学的研究人员将焦点放在了能够促进iPSC生成的表观遗传学因子上。
在这篇文章中，研究人员证实组蛋白H3K36me2特异性脱甲基酶Kdm2b能够促进iPSC生成。这一能力主要依赖于它的脱甲基酶和DNA结合活性，但并不依赖于其抗衰老作用。Kdm2b在重编程过程之初期发挥功能，促进了重编程早期反应基因的激活。而这一效应是通过Kdm2b结合和使基因启动子脱甲基化而实现的。
新研究揭示了一个在体细胞重编程中起重要调控作用的表观遗传学因子Kdm2b以及分子机制，从而为开发出新的iPS技术提供了新的研究方向。
近年来张毅教授在表观遗传学机制研究中取得了不少重要的成果。比如去年其研究组在Nature杂志上发表的文章中发现Tet1蛋白不仅能调控CpG富集启动子处的DNA甲基化水平，而且能促进干细胞中与多能性相关的因子的转录，以及参与Polycomb靶向的发育调控因子的抑制。而在另一篇Science文章中称发现了第7种，和第8种DNA碱基：5-胞嘧啶甲酰（5-formylcytosine），5-胞嘧啶羧基（5-carboxylcytosine）。这两种碱基实际上都是由胞嘧啶经由张毅教授研究组一直研究的关键蛋白：Tet蛋白修饰后形成。（来源：生物通 何嫱）
植物的离体再生体系在许多物种中已经相当成熟，被广泛应用于农业生产和基因改良领域已有半个世纪的历史。愈伤诱导作为这个体系的起始步骤，长期以来被认为是植物体细胞脱分化的过程，而植物激素生长素在这个过程中起着关键的作用。然而，愈伤发生的分子机制长期以来困扰着科学家，其主要原因之一是控制植物愈伤发生过程的关键因子一直没有被发现。
中科院植物研究所胡玉欣研究组以拟南芥为材料，发现了4个LBD（LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN）转录因子是生长素诱导愈伤形成的关键因子。这些转录因子位于生长素信号通路中ARFs (Auxin Response Factors)的下游，在愈伤诱导培养基上异位高表达。在拟南芥中高表达LBD基因能够引起器官在无外源生长素的培养基上自发产生愈伤组织（图1A），而LBD基因功能缺失后，严重抑制了生长素诱导愈伤的发生过程（图1B）。通过根干细胞特异基因的表达发现，LBD控制的愈伤发生模拟了生长素诱导的愈伤发生过程，是通过异位激活侧根发生的信号通路实现的。
上述研究发现了LBD转录因子是植物离体再生中控制愈伤形成的关键因子，建立了植物再生体系中生长素信号通路和愈伤诱导的分子联系（图2），将有助于进一步理解植物细胞全能性的控制机制和动植物细胞多能性调控的进化联系。
相关研究论文LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN transcription factors direct callus formation in Arabidopsis regeneration已于4月17日在《细胞研究》（Cell Research）在线发表（DOI:10.1038/cr.2012.63）。胡玉欣研究组博士生范明珠和助理研究员徐重益博士为该论文的共同第一作者。
该研究得到了科技部重大科学研究计划项目和国家自然科学基金的资助。
日期：2012年4月25日 - 来自
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WRKY类转录因子调控植物生长发育的多个方面，其基因表达也受到多种非生物胁迫的影响。但这类转录因子在植物尤其是农作物耐受非生物胁迫方面的作用研究较少。
中科院遗传与发育生物学研究所陈受宜、张劲松和张正斌3个实验室合作分析了小麦中WRKY转录因子基因家族的成员，鉴定了胁迫应答基因，并研究了相关基因的耐逆性。研究人员通过EST分析鉴定了小麦的43个TaWRKY基因，随着基因组的完成，将有更多的小麦WRKY基因得到鉴定。在这些鉴定的基因中有多个基因受到多种胁迫的诱导，他们从中选定了WRKY2和WRKY19作进一步分析。
这两个蛋白均定位于细胞核，可特异结合典型的顺式作用元件W-box。通过转基因分析和胁迫下的表现及生理指标分析，研究人员发现在拟南芥中过表达WRKY2可提高转基因植物的耐盐耐旱性，而过表达WRKY19可提高转基因植物的耐旱耐盐和耐冷性。WRKY2可结合耐逆及胁迫应答基因STZ和RD29B的启动子并激活其表达。WRKY19可结合DREB2A和Cor6.6启动子并激活其表达，同时WRKY19也调控RD29A和RD29B的表达，但可能不是通过直接结合其启动子。两个基因对植物在不同胁迫下的耐受性提高可能是由于调控了不同的下游基因。
该研究鉴定了小麦中可提高耐逆性的WRKY基因，为改善作物耐逆性及相关的基因工程提供了重要基因资源和理论依据。
相关论文于1月5日在线发表于Plant，Cell & Environment (doi: 10.1111/j.1365-3040.2012.02480.x.)。这3个实验室共同培养的学生牛灿芳为第一作者。该项研究受到了973、中科院项目和转基因专项的资助。
日期：2012年1月12日 - 来自
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近日来自美国哈佛-麻省理工的博德研究所、霍华德• 休斯医学研究所、麻省总医院和哈佛医学院等机构的研究人员在新研究中利用一种新技术揭示了染色质调控蛋白以特异性组合的方式参与调控染色质的结构和活性的机制。相关研究论文于12月23日发表在《细胞》（Cell）杂志上。
领导这一研究的是来自麻省总医院和哈佛医学院病理学系副教授、博德研究所资深研究员Bradley Bernstein以及博德研究所核心成员、麻省理工学院副教授Aviv Regev。
“我们知道许多不同的染色质调控因子参与操纵了染色质的结构和活性，然而一直以来对于这些调控因子作用机制却并不是很清楚，”博德研究所表观基因组学项目负责人Charles Epstein解释说。
“我们希望能够找到一种途径来研究这些染色质调控因子的组合机制，”文章的共同第一作者、麻省总医院和博德研究所博士后研究员Alon Goren说。尽管过去的十年来，研究人员获得了大量关于组蛋白修饰及其对染色质影响的信息数据，在多种细胞类型中证实了组蛋白修饰对基因、蛋白质及酶的调控作用。然而对于这些因子和复合物是如何增加、消除及维持组蛋白修饰的机制仍知之甚少。Goren补充说：“新研究为我们提供了一种了解染色质调控的新的系统性的方法。”
在这篇文章中，研究人员开发出了一种称为“ChIP-string”的新技术，将常规的染色质分析技术“染色质免疫沉淀法”与研究基因表达Nanostring nCounter分析系统相结合。利用这一技术对两个不同细胞系中的染色质调控因子进行了全面筛查分析。“利用新技术，我们对两种不同人类细胞系中的30种染色质调控因子进行了研究，揭示了这些因子以一种高效组合的方式协同发挥功能。”
研究小组发现这些调控因子以特定的方式组合形成模块从而协同发挥功能。研究人员在癌细胞系中发现了6种不同的模块。在这些模块中，特异性的激活因子与抑制因子相互组合就像相互连接的齿轮一样协同发挥作用，从而表现出双功能特性。Goren 解释说：“我们在染色质的调控区域发现了这种模块化和双功能性特征，我们认为该机制有可能对细胞起着重要的微调控作用。”
在进一步的统计学数据分析中，研究人员发现一种调控因子实际上可参与组合多种不同的模块，差别只是其中一些组合力较强，而另一些较弱。“根据组合的不同，调控因子表现出不同的活性，”Goren说。
谈到下一步的计划，研究小组表示他们希望能根据染色质调控因子的活性分类来推测出组蛋白的修饰模式。利用RNAi技术，他们将进一步通过敲除染色质调控模块元件的方式研究这些因子的功能及影响。“这使得我们能够更深入地从功能上了解当某些特异的染色质调控因子功能受扰时将要发生的分子事件，”Epstein说。（来源：生物通 何嫱）
在人类基因组序列首次发布10年之后，研究人员发现关于影响基因功能的机制的新线索。Bradley Bernstein和Aviv Regev领导的研究小组集中研究染色质---与DNA相结合的促进基因表达的非基因物质---和协调染色质活性的特异性调节物，其中Bradley Bernstein是马萨诸塞州总医院和哈佛医学院病理学副教授，也是布洛德研究所(Broad Institute)的准会员，而Aviv Regev是布洛德研究所核心成员，也是麻省理工学院副教授。布洛德研究所表观基因组计划(Epigenomics Program)经理Charles Epstein解释道，“我们知道很多不同的染色质调节物指导染色质结构和活性。”但是这些这些调节物如何操作的细节人们一直不清楚。
根据2011年12月23日发表在《细胞》杂志上的一篇研究论文，研究小组发现染色质调节蛋白的特异性组合控制比较重要的染色质活性，比如组蛋白修饰。组蛋白是组成染色质的非基因物质的一部分。通过修饰这些蛋白，染色质影响内在的DNA遗传密码如何翻译。
共同第一作者Alon Goren是马萨诸塞州总医院和布洛德研究所的一名博士后，他说，“我们想发现一种方法来研究调节染色质的蛋白因子组合”。过去十年以来，研究人员已发现大量关于组蛋白修饰及其对染色质影响的重要性的新信息。科学家们已经在很多细胞类型中证实组蛋白修饰与基因、蛋白和酶调节之间存在广泛关联。Goren补充道，“但是我们对增加、移除和维持这些组蛋白修饰的我们称作染色质调节物的蛋白因子和复合物的认识仍然不深。这篇研究展示了一种系统性方法来理解它们在染色质调节上的功能。”
通过设计一种新技术ChIP-string，即将一种研究染色质的标准方法即染色质免疫沉淀(chromatin immunoprecipitation, ChIP)和Nanostring公司nCounter分析系统(Nanostring nCounter Analysis System)平台结合在一起用于研究基因表达，研究小组开发出一种筛选方法在两种不同细胞类型中研究研究染色质调节物。共同第一作者Oren Ram是 Bernstein实验室的一名博士后，他补充道，“这种方法允许我们以一种非常强有力和有组织的方式了解到在两种人细胞类型---一种癌细胞系和胚胎干细胞中30种染色质调节物是如何工作的。通过这种方式，我们了解到很多关于它们的组装和它们彼此间关联方式的信息。”
特别地，研究小组发现染色质调节物以模块(module)或成组的方式一起运作。在癌细胞系中，他们检测到6个不同的模块，而且在每个模块内发现双功能性(bifunctionality)：特定激活物和抑制物一起在运转，就像是齿轮相互啮合在一起。Goren解释道，“我们发现染色质调节区域中的这种模块性和双功能性。我们认为这有助于细胞进行微调调控，就像精致刻度盘一样，能够按照需要进行调节。”
再者，研究人员观察到统计学证据：同样的调节物能够参与到不同组中或或者说将不同组连接在一起。这本质上不是物理结合(physical association)---尽管可能也才存在---，而是人们要理解调节物能够根据它们的功能加入到很多不同的组。一些结合是非常强的，而其他的结合则是比较弱的。Goren说，“根据复合物中调节物的不同，它的活性可能也是不同的。这有点类似于告诉我谁是你的朋友，而我则告诉为了谋生该做什么。”
展望未来，研究小组希望根据染色质调节物活性的类型预测组蛋白修饰模式。通过利用RNAi技术，他们将研究移除一个染色质-调节物模块中一个组分的影响。Epstein补充到，“这将允许我们从功能上理解当干扰特定染色质调节物出现时会发生什么。”
如今大量的癌症基因组研究正发现特定染色质调节物发生突变。提出在癌症治疗中使用染色质调节物--所谓表观遗传调节物---的抑制物的观点也是非常令人振奋的。Epstein说，“我们的论文为研究染色质调节复杂性打开一片新天地。通过详细描述这种复杂性，我们希望在癌症中特异性突变和这是否可能产生更好的诊断和治疗方法方面获得新的启示。”(生物谷
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