主题:霉菌

+ 关注 ≡ 收起全部文章
336*280_ads

转基因玉米可使有毒霉菌致命毒素静默

被感染的玉米。ErinCadigan/AlamyStockPhoto它是一个潜藏在常见食物中的沉默杀手。来自霉菌中的一种致癌毒素每年在全世界会导致千万人死亡,并迫使数百万吨感染作物被迫丢弃。但一种新方...即将发布

日期:2017年3月12日 - 来自[技术要闻]栏目
循环ads

微生物所在链霉菌启动子元件和内参基因研究中获进展


链霉菌组成型启动子筛选流程及相对强度

链霉菌是重要的抗生素产生菌,对链霉菌进行代谢工程和合成生物学改造需要大量不同强度的启动子元件。然而,前期链霉菌只有一个组成型启动子ermEp* 被广泛应用。中国科学院微生物研究所杨克迁课题组在2013年开发了活性明显高于ermEp* 的强启动子kasOp*(Appl. Environ. Microbiol. 2013;79(14):4484-92)。目前,kasOp* 已经被提供给多个国内、外的链霉菌研究组使用,同时也在该所张立新课题组和娄春波课题组的相关工作中得到应用(Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2015;112(39):12181-6)。

为了得到具有不同序列、不同强度特征系列组成型启动子,杨克迁课题组从天蓝色链霉菌不同培养条件下的时序转录组数据出发,经过一系列理性的分析遴选和实验验证,获得了166个不同强度的组成型启动子。这些启动子将为链霉菌合成生物学研究提供元件支撑。相关工作发表在Microb. Cell Fact.,李珊珊和王俊阳为并列第一作者,研究员杨克迁和助理研究员王为善为并列通讯作者。

另外,转录水平的相对定量分析是链霉菌基础和应用研究的必要环节。最近有若干文献报道看家sigma因子hrdB 基因的转录水平是生长依赖的,不是理想的内参基因。杨克迁课题组结合不同培养条件下的时序转录组数据和后续的同源分析、內源外源扰动分析、功能分析和转录丰度分析,得到若干内参基因;进一步通过对候选内参基因转录水平的实验和普适性验证,鉴定得到了5个有普适性和不同表达丰度特征的内参基因。这些内参基因能够满足链霉菌中不同转录强度目的基因的转录本相对定量分析;它们协同使用将会显著提高转录分析的数据质量。相关文章发表在Sci. Rep.,李珊珊和王为善为并列第一作者,杨克迁为通讯作者。

以上研究获得国家“973”计划项目和国家自然科学基金资助。

日期:2015年11月13日 - 来自[技术要闻]栏目

微生物所杨克迁课题组在链霉菌调控网络研究中获新进展


转录抑制蛋白筛选Biosensor原理示意图

转录水平上的调控在微生物生命活动中起着关键作用,基因转录的开启和关闭主要通过转录因子与启动子的相互作用来实现。而大量的转录因子之间又存在着交互调控,这些调控关系构成复杂的调控网络控制微生物的行为。因此,只有在全基因组水平解析微生物的调控网络,才能深入认识生命活动的复杂调控机制。 

链霉菌是重要的抗生素产生菌。为了在全基因组水平系统地解析链霉菌调控网络,杨克迁课题组建立了可应用于转录抑制因子筛选的Biosensor技术平台,同时改进完善了链霉菌ChIP-seq研究方法。进而运用这些手段,在链霉菌发现了大量的全新的调控关系,并鉴定了若干调控通路、motif和局部调控网络,推进了对链霉菌复杂调控系统的认识。 

转录抑制因子筛选Biosensor原理如图1,该Biosensor有三个特点:通过一个NOT gate 遗传电路,将抑制蛋白输入的负信号转化为报告基因输出的正信号,方便了抑制蛋白的筛选和表征;运用新的基因文库构建方法,实现了在全基因组水平上构建调控因子表达文库及其在大肠杆菌中的筛选;以xylE-neo双报告基因为输出信号,利用抗性平板筛选和颜色反应定量发现并表征转录抑制因子。利用该Biosensor,我们成功在天蓝色链霉菌和阿维链霉菌筛选到5个控制信号分子合成的新转录抑制因子,相关文章发表在Sci. Rep.(DOI: 10.1038/srep15887),王为善助理研究员和李肖同学为并列第一作者,杨克迁研究员为通讯作者。 

结合Biosensor技术和本实验室改进的ChIP-seq技术,我们针对γ-丁酸内酯信号和抗生素信号展开了相关调控网络研究,鉴定了ScbR和ScbR2在天蓝色链霉菌基因组上的结合靶点。进而建立了天蓝色链霉菌中γ-丁酸内酯和抗生素信号介导的全局性的调控网络。阐释了ScbR和ScbR2控制了天蓝色链霉菌的初级代谢、次级代谢、营养利用、蛋白质合成和压力应激等生命活动。并从我们鉴定的调控网络中,抽提了若干调控通路、feed forward loop motif和局部调控网络(图2),它们在应对环境变化和维持自身生理功能的稳定中发挥重要作用,这也为系统层次上认识细菌调控和表型提供了新角度。γ-丁酸内酯和抗生素信号分子在链霉菌中广泛存在,在模式菌天蓝色链霉菌中对其调控网络的阐明,将为其它链霉菌中信号网络的研究提供指导和借鉴。相关文章发表在Sci. Rep. (DOI: 10.1038/srep14831),李肖同学为第一作者,杨克迁研究员和王为善助理研究员为并列通讯作者。

以上研究获得国家“973”计划项目和国家自然科学基金资助。 

日期:2015年11月5日 - 来自[技术要闻]栏目
循环ads

微生物所在链霉菌中首次实现单细胞水平的转译元件强度表征


链霉菌是抗菌药物、农药、抗癌药物和免疫抑制剂等具有生物活性的微生物次级代谢产物的一个重要来源,但令人沮丧的是,利用传统的高通量筛选方法和单菌多产物(one strain many compounds)策略发现新药物的难度越来越大。链霉菌基因组的破译展示给我们大量未被解析的基因簇,预示着新的生物活性物质的存在。尽管链霉菌的基因组比酿酒酵母小得多,却具有更多的ORF,大部分用于调控基因簇的转录和翻译。然而由于链霉菌丝状生长的特性使其基因表达调控难以精确设计、定量和预测,成为合成生物学在该领域发展的一个巨大的技术瓶颈。

最近,一项发表在《美国科学院院报》上的研究结果为我们解决了上述难题。来自中国科学院微生物所的娄春波研究员和张立新研究员的研究团队合作建立了一个基于流式细胞仪和绿色荧光蛋白sfGFP的单细胞精确定量方法,用于鉴定链霉菌中的调控元件。

他们首先在链霉菌基因组中引入强启动子表达的sfGFP基因,然后利用溶菌酶制备原生质体。由于制备原生质体过程中保持原生质体渗透压的蔗糖缓冲液会损坏流式细胞仪,他们使用了另一种缓冲液替代了蔗糖缓冲液,同时使用碘化丙啶(propidium iodide ,PI)染色区分死细胞,然后利用共焦激光扫描荧光电子显微镜扫描。利用该方法,他们对200个天然的或合成的启动子和200个RBS进行高通量表征。另外又利用绝缘子RiboJ消除了启动子和RBS之间的干涉,提高了这些调控元件的模块性。利用这些调控元件,他们以一种可预测的方式成功地激活并提高了阿维链霉菌(Streptomyces avermitilis)中的沉默基因簇番茄红素的表达。他们的研究提供了一个定量测量方法以及通用的模块化调控元件,促进了链霉菌中基因簇功能优化和药物发现过程。

段春兰 摘译自: http://www.pnas.org/content/early/2015/09/14/1511027112

更多生物催化内容请关注微信公众服务号:生物催化剂设计与改造服务(STS-iDeep)


日期:2015年9月28日 - 来自[技术要闻]栏目

微生物所在链霉菌合成生物学调控元件定量分析方面获得新进展


链霉菌是抗菌药物、农药、抗癌药物和免疫抑制剂等具有生物活性的微生物次级代谢产物的一个重要来源,但令人沮丧的是,利用传统的高通量筛选方法和单菌多产物(one strain many compounds)策略发现新药物的难度越来越大。链霉菌基因组的破译展示给我们大量未被解析的基因簇,预示着新的生物活性物质的存在。尽管链霉菌的基因组比酿酒酵母小得多,却具有更多的ORF,大部分用于调控基因簇的转录和翻译。然而由于链霉菌丝状生长的特性使其基因表达调控难以精确设计、定量和预测,成为合成生物学在该领域发展的一个巨大的技术瓶颈。

最近,一项发表在《美国科学院院报》上的研究结果为我们解决了上述难题。来自中国科学院微生物所的娄春波研究员和张立新研究员的研究团队合作建立了一个基于流式细胞仪和绿色荧光蛋白sfGFP的单细胞精确定量方法,用于鉴定链霉菌中的调控元件。

他们首先在链霉菌基因组中引入强启动子表达的sfGFP基因,然后利用溶菌酶制备原生质体。由于制备原生质体过程中保持原生质体渗透压的蔗糖缓冲液会损坏流式细胞仪,他们使用了另一种缓冲液替代了蔗糖缓冲液,同时使用碘化丙啶(propidium iodide ,PI)染色区分死细胞,然后利用共焦激光扫描荧光电子显微镜扫描。利用该方法,他们对200个天然的或合成的启动子和200个RBS进行高通量表征。另外又利用绝缘子RiboJ消除了启动子和RBS之间的干涉,提高了这些调控元件的模块性。利用这些调控元件,他们以一种可预测的方式成功地激活并提高了阿维链霉菌(Streptomyces avermitilis)中的沉默基因簇番茄红素的表达。他们的研究提供了一个定量测量方法以及通用的模块化调控元件,促进了链霉菌中基因簇功能优化和药物发现过程。

段春兰 摘译自: http://www.pnas.org/content/early/2015/09/14/1511027112

更多生物催化内容请关注微信公众服务号:生物催化剂设计与改造服务(STS-iDeep)


日期:2015年9月25日 - 来自[技术要闻]栏目
循环ads

洽洽回应瓜子霉菌超标:或是流通环节保管不当所致的个案

2月12日,四川省食品药品监督管理局在节前专项监督抽检工作中发现,重庆洽洽食品有限公司所生产的洽洽原香瓜子经检测霉菌项目不合格。对此,洽洽食品相关负责人回应中国经济网记者称,公司原香瓜子霉菌超标情况可能是在流通环节因储存、保管不当,导致个别包装受损,加上终端仓库存储环境的湿度较大、温度较高,导致包装受损的瓜子霉菌检测不合格。

该负责人表示,公司已经第一时间组织原因分析且对同批次的产品及同批次原料生产的产品送国家权威机构检测,检测结果符合国家相关标准要求。此外,公司自生产原香瓜子产品以来,内部定期对霉菌项目做监控,每年两次以上送国家权威部门检测,从来未出现过霉菌超标现象,检测卫生结果均符合GB19300标准要求。

据了解,影响霉菌产生的关键因素有温度、基质、湿度、空气流通等,在食品含水量较低、温度稳定的情况下,霉菌难以生长和繁殖。故食品防霉主要是对食品水分、储存温度及相对湿度进行有效控制。洽洽负责人告诉记者,洽洽原香瓜子产品经过高温干燥炒制,其中供热温度达到260±5℃,炒制过程温度约165℃ ,炒制时间约为17分钟,干燥后的成品水分按公司标准均控制在2%以内,霉菌在这样的条件下完成全被灭活,故洽洽原香瓜子在生产过程一般不会产生霉菌。此外,瓜子以纸塑复合袋为包装材料,其透湿≤2g/(m2.24h),透氧≤4cm3/(m2.24h.0.1MPa),且内置有吸氧剂,成品包装为吸瘪状态,即霉菌生长的湿度、空气流通两个条件均不满足。

对此,该负责人表示,此次四川省食品药品监督管理局抽检原香瓜子霉菌超标,可能是在流通环节因储存、保管不当,导致个别包装受损,加上终端仓库存储环境的湿度较大、温度较高,导致包装受损的瓜子霉菌检测不合格。



日期:2015年2月13日 - 来自[安全快报]栏目

北京通报不合格食品 “忆佳乐”盐焗腰果被检出霉菌超标5倍

年货大市开场,多家超市干果类销量激增,而因运输和存储条件导致干果易变质,需格外注意“问题干果”。市食药监局今天上午通报,“忆佳乐”盐焗腰果被检出霉菌超标5倍。同批被检出不合格的还有7种食品,现决定在流通领域采取停止销售措施。

问题腰果霉菌超5倍

该腰果不合格的原因是霉菌超标5倍。食品专家苏女士表示,干果类产品因为表面附着调味料,即使是出现菌丝,也难以察觉。而食品中出现霉菌大多是由于生产环境过于潮湿,没有做好必要的消毒和防护导致的。

此外,“奇尔”情人梅、“荣园”九制雪梅,以及北京张代坤干菜调料摊生产的黄花菜二氧化硫超标。其中,黄花菜超标近17倍,最为严重。

市食品药品监督管理局提醒,凡已购买上述不合格批次食品的消费者可凭购物小票和外包装向销售单位要求退货。

干果热销 买前闻闻味

记者走访沃尔玛、物美、家乐福、永辉等多家超市发现,干果类产品是仅次于糖果类的热销年货。沃尔玛工作人员称,光是散装美国开心果,销售量就同比增加了7成左右。

在挑选时,建议不要选过分白的干果。购买散装干果时,多闻闻味道,如果油脂的味道盖过干果本身的味道,尽量不要购买;购买包装干果时,注意出厂的时间,透过包装仔细观察品相是否完整等。

本周下架食品

样品名称 生产日期(2014年) 标注生产单位名称 不合格项目(标准值/实测值)

忆佳乐盐焗腰果 4/24 淄博明润食品有限公司 霉菌 cfu/g (≤25/150)

黄花菜 6/28 北京张代坤干菜调料摊 二氧化硫 g/kg(≤0.2/3.46)

荣园九制雪梅 4/10 潮安县荣园食品有限公司 二氧化硫 g/kg (≤0.35/5.4)

奇尔情人梅 5/20 潮安县奇尔食品有限公司 二氧化硫 g/kg (≤0.35/1.8)

家佳利饺子馆(油炸型膨化食品)  6/1    新郑市兴业食品有限公司 过氧化值 g/100g (≤0.25/3.6)

大霸王多味串(挤压豆粉熟食) 8/10      浏阳市名之味食品有限公司 山梨酸 g/kg (≤1.0/1.4)

笨小孩铁板牛筋(调味面制食品) 8/7     郑州市管城区佳俊食品厂 环己基氨基磺酸钠 g/kg (≤1.6/3.4)



日期:2015年2月4日 - 来自[安全快报]栏目
循环ads

捷森进口麦片日日升早餐奶霉菌超标

  广州市食安办发布第十八期食品安全信息 不合格食品占4.4%

  生活指数

  产品质量权威发布

  昨天,广州市食安办发布第十八期食品安全信息。本期公布的抽检食品共1141批次,其中合格食品1091批次,占95.6%;不合格食品50批次,占4.4%。本次不合格产品都是日常生活中的常见食品,包括桶装水、方便食品、调味品、食糖等。

  在本期抽检中,广州市食药监局对生产环节和流通环节中的蜂产品进行了抽查。其中,江西意蜂实业有限公司的“幸花园”牌桂花蜂蜜,果糖和葡萄糖的含量仅为30克/100克,只有最低标准值的一半。

  据了解,果糖和葡萄糖是蜂蜜的主要甜味成分和重要质量特性指标,我国现行食品标准规定,蜂蜜中果糖和葡萄糖的含量不得低于60%。市食安办解释,蜂蜜中果糖和葡萄糖含量偏低,可能是因为蜂蜜未经蜜蜂充分酿造,也可能是蜂蜜中掺入了淀粉糖浆或砂糖的蜂蜜。

  至于抽检为不合格的几款方便食品,原因大部分为霉菌超标:新海冰糖蜜味马蹄糕粉超标20%,日日升五谷营养早餐奶超标1倍多,穗丰园手磨纯香黑芝麻(14.00, 0.14, 1.01%)糊霉菌超标近9倍;2014年8月生产的1公斤装jason捷森六种谷物麦片,除了霉菌超标两倍多,水分也超标近1倍。抽检信息显示,这款麦片的经销商为北京嘉盛行商贸有限公司,记者在部分网上购物平台搜索显示,同样规格的产品仍在销售,售价在40元~50元之间。

  产品介绍中指,捷森麦片由德国捷森公司生产,原料来自德国优质小麦产区,向全球87个国家出口包括营养麦片和全面包在内的所有使用产品。

  饮用瓶装水、桶装水在本专栏发布的不合格产品中一直占有不小比例,本次25批次瓶装水、桶装水登上“黑榜”,占本次不合格产品的一半,大部分都为菌落总数超标。

  市食安办解释,饮用水微生物指标超标有可能是生产工艺、生产环境、人员卫生及包装容器控制不严等因素,也有可能是桶装容器清洗消毒及瓶盖密封性不好等造成的产品质量不稳定,同时流通环节的运输、储存条件的质量控制也不容忽视,它也是容易造成产品不合格的原因之一。

  消费小贴士

  如何判别真假蜂蜜

  选购蜂蜜时,首先看性状。真蜂蜜是黏稠的液体,挑起可见柔性长丝,不断流。而假蜂蜜有悬浮物或沉淀,黏度小,挑起时呈珠状下落,有断流。在暴晒后,真蜂蜜会变得稀薄,而假蜂蜜无变化或更黏稠。如果蜂蜜极稀,容易流动,则可能是掺了水的。

  其次要看标签。有一些蜂蜜产品的配料表中注明含有蔗糖、白糖等成分,而纯正的蜂蜜产品不允许加入这些物质。

  除此以外,真蜂蜜气味纯正、自然,有淡淡的植物味的花香,而假蜂蜜闻起来有刺鼻异味或水果糖味。真蜂蜜吃起来香甜可口,有黏稠餬嘴感,有轻微的淡酸味,后味悠长,品尝结晶块时“咬之即酥,含之即化”。假蜂蜜仔细品尝有苦涩味或化学品怪味,没有芳香味,结晶块咀嚼就像砂糖,声脆响亮。

  另外,对于市场上出售掺水或其他杂质的蜂蜜,可用以下方法识别:将蜂蜜滴在白纸或草纸上,如果纸上的蜂蜜渐渐渗开,说明掺有蔗糖和水;将少量蜂蜜放入杯中,加适量水,煮沸,待冷却后,滴几滴碘酒,如果溶液颜色变蓝说明掺有淀粉。


日期:2015年1月20日 - 来自[安全快报]栏目
共 31 页,当前第 1 页 9 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 :

ads

关闭

网站地图 | RSS订阅 | 图文 | 版权说明 | 友情链接
Copyright © 2008 39kf.com All rights reserved. 医源世界 版权所有
医源世界所刊载之内容一般仅用于教育目的。您从医源世界获取的信息不得直接用于诊断、治疗疾病或应对您的健康问题。如果您怀疑自己有健康问题,请直接咨询您的保健医生。医源世界、作者、编辑都将不负任何责任和义务。
本站内容来源于网络,转载仅为传播信息促进医药行业发展,如果我们的行为侵犯了您的权益,请及时与我们联系我们将在收到通知后妥善处理该部分内容
联系Email: