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指纹谱相似度软件使用说明

来源:王龙星 作者:王龙星 打印本文 放入收藏夹 收藏到新浪

摘要:指纹谱相似度软件使用说明一、 本软件的功能是根据两指纹谱的积分报告(气相液相都可以)自动进行峰匹配并按照向量夹角法计算它们的相似度。由于不需要考虑烦杂的原始谱图数据点因此使用简单、计算速度非常快。在进行自动峰匹配时按下列原则进行:(1) 同一分析条件下两张指纹谱对应色谱峰的保留时间差异在合理的范围以内。......


指纹谱相似度软件使用说明

 

一、 本软件的功能是根据两指纹谱的积分报告(气相液相都可以)自动进行峰匹配并按照向量夹角法计算它们的相似度。由于不需要考虑烦杂的原始谱图数据点因此使用简单、计算速度非常快。在进行自动峰匹配时按下列原则进行:

(1)              同一分析条件下两张指纹谱对应色谱峰的保留时间差异在合理的范围以内。本软件的默认值认为保留时间的最大漂移在0.8min以内。在使用本软件时,用户需要根据自己实验过程中保留时间的重复性,使用本软件的设定保留时间最大漂移功能(1)来指定这个范围。

(2)              同一分析条件下两张指纹谱的出峰次序不变。

(3)              在满足(1)(2)的同时寻找使相似度最大(峰高最接近)的峰匹配结果。

(详细原理请参考药学学报2002  9 P713 王龙星等人的文章)

二、 本软件适用下列操作系统,win95,98,NT,2000,XP(需带简体中文显示支持)

三、 本软件不需要安装,只要将所有文件解压缩到一指定的目录就可运行。本软件为试用版,可以免费使用15次。如果想得到正式版,请和作者联系。(E-mail: Wanglx@dicp.ac.cn, 0411-3701020 王龙星)

四、 获得重复性与分离度良好的色谱图是指纹谱实际应用的前提。对液相色谱最大保留时间漂移最好在0.8min内,最大不要超过1.0min。如果保留时间重复性很差则无论是人工或计算机都难以获得可靠的计算结果。对气相色谱,只要使用的仪器不太糟糕就不难达到上述要求。但对液相色谱来说下列几点需要注意:

(1)            一定使用带柱温控制的色谱仪,避免环境温度对保留时间的影响

(2)            中药提取物比较复杂,每个样品分析完成后最好用20-30ml四氢呋喃或异丙醇冲洗柱子,避免样品残留对下次分析的影响。

(3)            平衡时间要足够,对一般分析要保证使用2535ml的初始流动相平衡柱子,如果使用带乙酸等离子抑制剂的流动相,则平衡时间还要适当延长。

(4)            建议将使用1.5-2.0ml/min的高流速(在仪器系统能够允许的前提下),使用高流速可以在保证分离度基本不改变的前提下大大缩短分析时间和平衡时间。比如在1.0ml/min的流速下如果梯度的斜率是2.0%/min那么在2.0ml/min的流速下斜率设为4.0%/min可获得分离度完全相同的色谱图,并且分析平衡速度加快一倍。

五、计算相似度即可以使用峰高也可以使用峰面积。很多人认为采用峰面积计算相似度更准确。但一般来说中药指纹谱较复杂,很多峰没有达到基线分离,并且大多数中药指纹谱的基线不平稳有波动,这些因素会对峰面积的积分数值产生很大影响,尤其是小的色谱峰。根据我们实验室的实践与经验,采用峰高计算指纹谱相似度反而准确性更高。

六、请仔细挑选用作对比标准的标准谱图,标准谱图应当是色谱峰较多,且有代表性的指纹谱。此外请仔细选择工作站积分参数确保信噪比>3的色谱峰被列入积分报告并且信噪比太小的干扰峰不被积分。这对有一定经验的色谱工作者是不难办到的。

七、 在计算前需要引入积分报告,本软件提供了两种方式:

(1)              将存在word表格, excel等表格内的报告以拷贝粘贴的方式引入程序并计算,即控制菜单内的粘贴标准数据与粘贴样品数据(见图1)

(2)              打开文本格式的文档即打开标准与打开样品两按钮(见图1)。文本格式如下:文本由两列构成,一列为保留时间数值,第二列是峰高(或峰面积);两列之间以逗号、或制表符分开。(见图1)

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八、 引入所有数据后,按计算按钮即得到计算结果。需要注意的是每次计算都要重新引入标准以及样品的积分报告。本软件附带了两个文本格式的黄芩的指纹谱积分报告,Sample1.txt Sample2.txt,用户可用它们练习计算一下。

发布日期:2007-5-18

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