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SARS流行后发现越来越多的冠状病毒

来源:生物谷 作者: 2011-8-14
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摘要: 最近严重急性呼吸综合征(SARS)的流行提升了全球学者们寻找新的人类和动物冠状病毒的兴趣。我们实验室对其中9种冠状病毒进行了测序,包括人冠状病毒HKU1(β冠状病毒亚群A),SARS相关菊头蝠属蝙蝠冠状病毒(β冠状病毒亚群B),菊头蝠属蝙蝠冠状病毒HKU2(α冠状病毒),β冠状病毒2个新亚群(C和D)的3种蝙蝠冠状病毒......


最近严重急性呼吸综合征(SARS)的流行提升了全球学者们寻找新的人类和动物冠状病毒的兴趣。有全基因组的冠状病毒种数不断增加,自2003年的9种增至2011年的30种左右;我们实验室对其中9种冠状病毒进行了测序,包括人冠状病毒HKU1(β冠状病毒亚群A),SARS相关菊头蝠属蝙蝠冠状病毒(β冠状病毒亚群B),菊头蝠属蝙蝠冠状病毒HKU2(α冠状病毒),β冠状病毒2个新亚群(C和D)的3种蝙蝠冠状病毒和3种禽冠状病毒[它们构成所提出的新属(δ冠状病毒)]。



为了迅速和精确地成批测序检索(这是比较基因和基因组分析的基础和瓶颈),最近我们还开发了注解冠状病毒基因和基因组的综合数据库,CoVDB(http://covdb.microbiology.hku.hk)。随着可获得的基因组数量和方便用户的数据库数量的增加,可以产生用于高效下游分析的便于比较基因组的分析和更具体的爆炸性搜索结果。



注:该报告曾收集于《第五届地坛国际感染病会议论文摘要》(

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